四、研發(fā)費(fèi)用加計(jì)扣除備案和申報(bào)管理

（一）享受研發(fā)費(fèi)用加計(jì)扣除優(yōu)惠政策基本流程

享受研發(fā)費(fèi)用加計(jì)扣除優(yōu)惠政策主要有以下關(guān)鍵資料和程序：

1.年度納稅申報(bào)前進(jìn)行優(yōu)惠備案并準(zhǔn)備好留存?zhèn)洳橘Y料；

2.填寫并報(bào)送《“研發(fā)支出”輔助賬匯總表》；

3.在年度納稅申報(bào)表中填報(bào)研發(fā)費(fèi)用加計(jì)扣除優(yōu)惠附表及欄次。 

完整流程見上圖。

（二）研發(fā)費(fèi)用加計(jì)扣除優(yōu)惠備案的要點(diǎn)

1.自行判斷。根據(jù)76號公告規(guī)定，企業(yè)應(yīng)自行判斷其是否符合研發(fā)費(fèi)用加計(jì)扣除政策規(guī)定的條件。

2.履行備案。研發(fā)費(fèi)用加計(jì)扣除實(shí)行備案管理，凡享受研發(fā)費(fèi)用加計(jì)扣除優(yōu)惠的，企業(yè)應(yīng)當(dāng)不遲于年度匯算清繳納稅申報(bào)時(shí)，向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)報(bào)送《企業(yè)所得稅優(yōu)惠事項(xiàng)備案表》和研發(fā)項(xiàng)目文件，履行備案手續(xù)。按照76號公告規(guī)定，研發(fā)費(fèi)用加計(jì)扣除優(yōu)惠不屬于定期減免稅事項(xiàng)，在費(fèi)用化項(xiàng)目發(fā)生當(dāng)期或者資本化項(xiàng)目形成無形資產(chǎn)后的攤銷期間，應(yīng)每年履行備案手續(xù)；企業(yè)同時(shí)存在多個(gè)享受優(yōu)惠研發(fā)項(xiàng)目的，應(yīng)當(dāng)按不同項(xiàng)目分別進(jìn)行核算，并按項(xiàng)目分別進(jìn)行備案。

2015年度及以前按照原政策已審核立項(xiàng)的跨期研發(fā)項(xiàng)目延續(xù)至2016年度及以后的，在享受優(yōu)惠年度，應(yīng)每年履行備案手續(xù)。

屬于跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)，其分支機(jī)構(gòu)享受研發(fā)費(fèi)用加計(jì)扣除稅收優(yōu)惠。應(yīng)由二級分支機(jī)構(gòu)按規(guī)定向其主管稅務(wù)機(jī)關(guān)備案后，總機(jī)構(gòu)匯總所屬二級分支機(jī)構(gòu)已備案優(yōu)惠事項(xiàng)，在年度納稅申報(bào)時(shí)填寫《匯總納稅企業(yè)分支機(jī)構(gòu)已備案優(yōu)惠事項(xiàng)清單》一并報(bào)送。

3.留存?zhèn)洳橘Y料。企業(yè)對報(bào)送的備案資料、留存?zhèn)洳橘Y料的真實(shí)性、合法性承擔(dān)法律責(zé)任。企業(yè)應(yīng)按照97號公告，將相關(guān)資料留存?zhèn)洳?，保存期限為相關(guān)研發(fā)項(xiàng)目享受優(yōu)惠結(jié)束后10年。

企業(yè)應(yīng)當(dāng)按照稅務(wù)機(jī)關(guān)要求限期提供留存?zhèn)洳橘Y料，以證明其符合稅收優(yōu)惠政策條件。企業(yè)不能提供留存?zhèn)洳橘Y料，或者留存?zhèn)洳橘Y料與實(shí)際生產(chǎn)經(jīng)營情況、財(cái)務(wù)核算、相關(guān)技術(shù)領(lǐng)域、產(chǎn)業(yè)、目錄、資格證書等不符，不能證明企業(yè)符合稅收優(yōu)惠政策條件的，稅務(wù)機(jī)關(guān)將追繳其已享受的減免稅，并按照稅收征管法規(guī)定處理。

（三）享受研發(fā)費(fèi)用加計(jì)扣除優(yōu)惠政策的留存?zhèn)洳橘Y料

根據(jù)97號公告，企業(yè)應(yīng)保留下列留存?zhèn)洳橘Y料：

1.自主、委托、合作研究開發(fā)項(xiàng)目計(jì)劃書和企業(yè)有權(quán)部門關(guān)于自主、委托、合作研究開發(fā)項(xiàng)目立項(xiàng)的決議文件；

2.自主、委托、合作研究開發(fā)專門機(jī)構(gòu)或項(xiàng)目組的編制情況和研發(fā)人員名單；

3.經(jīng)科技行政主管部門登記的委托、合作研究開發(fā)項(xiàng)目的合同；

4.從事研發(fā)活動的人員和用于研發(fā)活動的儀器、設(shè)備、無形資產(chǎn)的費(fèi)用分配說明（包括工作使用情況記錄）；

5.集中研發(fā)項(xiàng)目研發(fā)費(fèi)用決算表、集中研發(fā)項(xiàng)目費(fèi)用分?jǐn)偯骷?xì)情況表和實(shí)際分享收益比例等資料；

6.“研發(fā)支出”輔助賬；

7.企業(yè)如果已取得地市級（含）以上科技行政主管部門出具的鑒定意見，應(yīng)作為資料留存?zhèn)洳?

8.省稅務(wù)機(jī)關(guān)規(guī)定的其他資料。

（四）享受研發(fā)費(fèi)用加計(jì)扣除優(yōu)惠政策但匯算清繳期結(jié)束前未備案的處理方法

根據(jù)76號公告規(guī)定，企業(yè)已經(jīng)享受稅收優(yōu)惠，但在匯繳期間未按照規(guī)定備案的，企業(yè)發(fā)現(xiàn)后應(yīng)當(dāng)及時(shí)補(bǔ)辦備案手續(xù)，同時(shí)提交《企業(yè)所得稅優(yōu)惠事項(xiàng)備案管理目錄》列示優(yōu)惠事項(xiàng)對應(yīng)的留存?zhèn)洳橘Y料。

企業(yè)已經(jīng)享受稅收優(yōu)惠，但在匯繳期間未按照規(guī)定備案的，稅務(wù)機(jī)關(guān)發(fā)現(xiàn)后，應(yīng)當(dāng)責(zé)令企業(yè)限期備案，同時(shí)提交《企業(yè)所得稅優(yōu)惠事項(xiàng)備案管理目錄》列示

優(yōu)惠事項(xiàng)對應(yīng)的留存?zhèn)洳橘Y料。

（五）享受研發(fā)費(fèi)用加計(jì)扣除優(yōu)惠政策匯算清繳時(shí)的有關(guān)規(guī)定

企業(yè)年度納稅申報(bào)時(shí)，根據(jù)《研發(fā)支出輔助賬匯總表》填報(bào)《研發(fā)項(xiàng)目可加計(jì)扣除研發(fā)費(fèi)用情況歸集表》，在年度納稅申報(bào)時(shí)隨申報(bào)表一并報(bào)送主管稅務(wù)機(jī)關(guān)。

根據(jù)《國家稅務(wù)總局關(guān)于2016年度企業(yè)研究開發(fā)費(fèi)用稅前加計(jì)扣除政策企業(yè)所得稅納稅申報(bào)問題的公告》（國家稅務(wù)總局公告2017年第12號）規(guī)定，對2016年度研發(fā)費(fèi)用加計(jì)扣除附表的填報(bào)有了新的要求。具體填報(bào)時(shí)，《研發(fā)項(xiàng)目可加計(jì)扣除研發(fā)費(fèi)用情況歸集表》中的第11行“當(dāng)期實(shí)際加計(jì)扣除總額”將自動帶入年度納稅申報(bào)表附表A107014《研發(fā)費(fèi)用加計(jì)扣除優(yōu)惠明細(xì)表》中合計(jì)行的第19列“本年研發(fā)費(fèi)用加計(jì)扣除額合計(jì)”（該表其余數(shù)據(jù)項(xiàng)無需填寫），同時(shí)帶入上級附表A107010《免稅、減計(jì)收入及加計(jì)扣除優(yōu)惠明細(xì)表》中第22行“開發(fā)新技術(shù)、新產(chǎn)品、新工藝發(fā)生的研究開發(fā)費(fèi)用加計(jì)扣除”。

（六）預(yù)繳所得稅時(shí)不能享受研發(fā)費(fèi)用加計(jì)扣除優(yōu)惠

根據(jù)《國家稅務(wù)總局關(guān)于發(fā)布〈企業(yè)所得稅優(yōu)惠事項(xiàng)辦理辦法〉的公告》（國家稅務(wù)總局公告2015年第76號）的規(guī)定，研發(fā)費(fèi)用稅前加計(jì)扣除政策屬于匯繳享受優(yōu)惠項(xiàng)目，因此企業(yè)實(shí)際發(fā)生的研發(fā)費(fèi)用，在年度中間預(yù)繳所得稅時(shí)，允許據(jù)實(shí)計(jì)算扣除，在年度終了進(jìn)行所得稅年度匯算清繳納稅申報(bào)時(shí)，再依照規(guī)定享受加計(jì)扣除優(yōu)惠政策。

（七）企業(yè)集團(tuán)集中開發(fā)的研發(fā)費(fèi)用分?jǐn)傂枰P(guān)注關(guān)聯(lián)申報(bào)

企業(yè)集團(tuán)根據(jù)生產(chǎn)經(jīng)營和科技開發(fā)的實(shí)際情況，對集中研發(fā)項(xiàng)目按照財(cái)稅〔2015〕119號文件規(guī)定歸集的可加計(jì)扣除的研發(fā)費(fèi)用，按照權(quán)利和義務(wù)相一致、費(fèi)用支出和收益分享相配比的原則，合理確定研發(fā)費(fèi)用的分?jǐn)偡椒?，在受益成員企業(yè)間進(jìn)行分?jǐn)偅上嚓P(guān)成員企業(yè)分別計(jì)算加計(jì)扣除。

企業(yè)集團(tuán)應(yīng)將集中研發(fā)項(xiàng)目的協(xié)議或合同、集中研發(fā)項(xiàng)目研發(fā)費(fèi)用決算表，集中研發(fā)項(xiàng)目費(fèi)用分?jǐn)偯骷?xì)情況表和實(shí)際分享收益比例等資料提供給相關(guān)成員企業(yè)。協(xié)議或合同應(yīng)明確參與各方在該研發(fā)項(xiàng)目中的權(quán)利和義務(wù)、費(fèi)用分?jǐn)偡椒ǖ葍?nèi)容。

根據(jù)《國家稅務(wù)總局關(guān)于完善關(guān)聯(lián)申報(bào)和同期資料管理有關(guān)事項(xiàng)的公告》（國家稅務(wù)總局公告2016年第42號）的規(guī)定，企業(yè)集團(tuán)開發(fā)、應(yīng)用無形資產(chǎn)及確定無形資產(chǎn)所有權(quán)歸屬的整體戰(zhàn)略，包括主要研發(fā)機(jī)構(gòu)所在地和研發(fā)管理活動發(fā)生地及其主要功能、風(fēng)險(xiǎn)、資產(chǎn)和人員情況等應(yīng)在主體文檔中披露。

（八）享受研發(fā)費(fèi)用加計(jì)扣除的研發(fā)項(xiàng)目無需事先通過科技部門鑒定或立項(xiàng)

自2016年1月1日起，企業(yè)申報(bào)享受研發(fā)費(fèi)用加計(jì)扣除優(yōu)惠，無需事前通過科技部門鑒定。

企業(yè)自主研發(fā)的項(xiàng)目，需經(jīng)過企業(yè)有權(quán)部門審核立項(xiàng)。也就是說，不需經(jīng)過科技部門和稅務(wù)部門進(jìn)行立項(xiàng)備案，只需企業(yè)內(nèi)部有決策權(quán)的部門，如董事會等做出決議即可。政府及相關(guān)部門支持的重點(diǎn)項(xiàng)目，根據(jù)政府部門立項(xiàng)管理的相關(guān)要求，需科技部門備案的特殊情況除外，但稅務(wù)部門對自主研發(fā)項(xiàng)目沒有登記的硬性要求。

委托研發(fā)及合作研發(fā)的項(xiàng)目立項(xiàng)則需要科技部門登記?！都夹g(shù)合同認(rèn)定管理辦法》（國科發(fā)政字〔2000〕63號）第六條規(guī)定：未申請認(rèn)定登記和未予登記的技術(shù)合同，不得享受國家對有關(guān)促進(jìn)科技成果轉(zhuǎn)化規(guī)定的稅收、信貸和獎勵等方面的優(yōu)惠政策；97號公告規(guī)定，委托及合作研發(fā)的，需提供經(jīng)科技行政主管部門登記的委托、合作研究開發(fā)項(xiàng)目的合同留存?zhèn)洳?。因此，?jīng)科技行政主管部門登記的委托、合作研發(fā)項(xiàng)目合同是享受研發(fā)費(fèi)用加計(jì)扣除的要件之一。